Sobre PPGBIOINFO

Nível

Mestrado Acadêmico

Objetivos

O PPGBIOINFO tem como objetivos principais:

- Capacitar os alunos para o desenvolvimento de conhecimentos científicos e sua aplicação na execução de atividades de pesquisa e de desenvolvimento visando a solução de problemas ou proposição de inovações tecnológicas para o avanço da fronteira do conhecimento em bioinformática;

- Definir, propor, coordenar e executar projetos de pesquisa e desenvolvimento tecnológico nas suas linhas de atuação, visando atender demandas específicas para o desenvolvimento nacional, regional e/ou local;

- Interagir com institutos de pesquisa, empresas, públicas e privadas, e com outras organizações, especialmente com as instituições participantes do PPGBIOINFO, no desenvolvimento de pesquisas interdisciplinares, na transferência de conhecimento e geração de inovação para contribuir no desenvolvimento destas organizações e, consequentemente, contribuir para o desenvolvimento local, regional e nacional.

Perfil profissional a ser formado

O egresso do PPGBIOINFO deve ser capaz de estudar os avanços no conhecimento do ponto de vista científico e tecnológico, e aplicar esse conhecimento para solucionar problemas e/ou propor novas metodologias científicas e inovações tecnológicas.

Área de concentração

Bioinformática

A área de concentração “Bioinformática” abrange a pesquisa, desenvolvimento e aplicação de técnicas e métodos computacionais e estatísticos para a produção de metodologias para análise e interpretação de dados biológicos de diversas naturezas, envolvendo dados genômicos, transcriptômicos, proteômicos, entre outros, com o objetivo na descoberta de conhecimento biológico a partir dos dados analisados.

Linhas de Pesquisa

Biologia computacional e sistêmica

Esta linha de pesquisa envolve:
(a) análise de sequências e filogenia por meio de modelos probabilísticos de sequências, algoritmos para busca e aglomeração de sequências, entre outras técnicas;
(b) biologia sistêmica com o estudo holístico da biologia molecular da célula, estudo das interações entre as componentes biológicas e como tais interações geram funções e controlam o comportamento do sistema;
(c) algoritmos evolutivos, por meio do desenvolvimento de algoritmos para otimização combinatória em problemas multidimensionais nos quais não é possível percorrer todo o espaço de características/combinações;
(d) ontologias, mineração de dados e banco de dados, por meio da extração de informações biológicas em textos, banco de dados e outras fontes de informação, integração de dados e ontologias biologicamente relevantes; e
(e) bioimagens que trata da aquisição, análise, mineração e visualização de imagens produzidas por microscópios com ênfase ao desenvolvimento interdisciplinar de técnicas para resolver problemas em diversos níveis: molecular, sub-celular, e super-celular.

Genética e Genômica

Esta linha de pesquisa envolve:
(a) análise de genomas, montagem de genomas, genômica comparativa, anotação de genomas e cromossomos, entre outros; 
(b) análise de expressão gênica, desenvolvimento de métodos estatísticos para reconhecimento de genes diferencialmente expressos, classificadores baseados em expressão, métodos para determinar e descrever redes de regulação, análise de vias, integração de dados de expressão, anotação de dados de expressão e genes ou conjunto de genes; e 
(c) genética de população por meio de análise de segregação, análise da linkage, análise de associação, construção de mapas genéticos, simulações de populações, haplotipagem, descoberta de marcadores e genotipagem.