O Herbário HCF possui uma pequena biblioteca sobre Botânica e assuntos correlatos. Este acervo bibliográfico está disponível ao público para consulta local. Empréstimos não são efetuados.

Dentre as coleções importantes estão: Flora Ilustrada Catarinense, Sellowia e a Flora Fanerogâmica da Ilha do Cardoso, além de outros títulos.

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